Paistu vallas on 2 põhikooli:
Paistu Põhikool asub Viljandi-Nuia maantee ääres Sultsis. Koolis õpib 160 õpilast Paistu, Halliste, Karksi vallast ja Viljandi linnast.
Holstre Põhikool asub Viljandi-Mustla maantee ääres Holstres. Koolis õpib 130 õpilast Paistu, Tarvastu, Viiratsi vallast ja Viljandi linnast.
Koolide ajaloost
Vanimad andmed talurahvakoolide kohta Paistus on pärit rootsi ajast. Keskvõim hakkas talurahva lugemaõpetamisega tegelema 17. sajandi teisel kolmandikul. Maakoolide rajamisele aitas kaasa B. G. Forseliuse tegevus. Ta asutas 1684 Tartu lähedale Piiskopimõisasse koolmeistrite ettevalmistamiseks seminari, andis välja uue aabitsa, võttis kasutusele uue kirjaviisi. 1686. a. asusid Forseliuse õpilased tööle ka Viljandimaal – Kolga-Jaanis, Pilistveres, Põltsamaal, 1687. a. ka Hallistes, Karksis, Suure-Jaanis ja Paistus. 1688. kirjutas Forselius, et Paistu kiriku juures õpetatakse lapsi lugema tema meetodi järgi. Kooli olemasolu Paistus märgiti ka samal aastal toimunud Viljandi maakoolide revisjoni käigus. Paistu esimese koolihoone asukoht pole teada. Arvatavasti on see kiriku lähedal Ojamäel, kuhu pärast Põhjasõda ehitati uus koolimaja. Holstre Pulleritsu koolimaja ehitati 1833, Loodi koolimaja 1835, Aidu koolimaja 1838.